最完整的转录组视图

从编码和非编码RNA种类中捕获最广泛的转录本

大乐透开奖时间:总RNA测序

超级大乐透中奖规则 www.slf2t.cn 利用TruSeq Stranded Total RNA试剂盒开展的总RNA测序(全转录组分析)可得到最完整的转录组图像,包括编码RNA和多种形式的非编码RNA。它可实现高度灵敏且准确的表达定量,以及鉴定转录组中已知的和新的特征。

Ribo-Zero试剂盒可高效去除高丰度的RNA种类,同时保留片段化和完整的转录本从而用于文库构建。总RNA测序(total RNA-Seq)在正常和低质量的FFPE样品中都能够实现最佳覆盖。

Total RNA-Seq分析编码RNA和多种形式的非编码RNA,从而提供对转录组的全面视图。

  • 鉴定已知的和新的转录特征
  • 使研究人员能够在最广泛的转录本中鉴定生物标志物
  • 可实现对感兴趣的表型更加全面的了解
  • 允许在很宽的动态范围内分析转录组
总RNA测序的优势

Avrum Spira博士,波士顿大学医学中心的一名肺部和重症监护医师,成立了一个实验室,以期通过全基因组基因表达芯片分析临床样本,以便开发出肺部疾病诊断和治疗的生物标志物。如今,Spira的实验室使用total RNA-Seq来发现那些表达芯片可能无法检测到的新的和稀有的转录本。
阅读案例研究。

从全基因组阵列向总RNA测序转变

Illumina提供完整的total RNA-Seq流程,可简化从文库制备到数据分析和生物学解释的整个过程。

除了精简、完整的流程,Illumina的边合成边测序(SBS)技术是最广泛采用的NGS技术,已产生全球大约90%的测序数据。*

单击下面的 可查看每个工作流程步骤的产品。

TruSeq Stranded Total RNA及Ribo-Zero试剂盒:
提供针对全转录组的完整视图和链特异性的精确测定。兼容FFPE样本。
NeoPrep Library Prep System

用于制备高质量NGS文库的系统,使用方便,并可兼容illumina的所有测序平台。

比较各种总RNA测序文库制备试剂盒

确定最适合自身需求的试剂盒。

NextSeq系列

灵活简约,适合全基因组、外显子组或转录组测序。每次运行测序3-10个总RNA样品。

HiSeq 2500系统

强大高效,每次运行测序8-96个RNA样品。

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统

高通量的RNA-Seq,HiSeq 3000每次运行最多可测序50个人的转录组,HiSeq 4000可测序100个转录组。

平台比较工具

比较各个测序平台,确定最适合您的实验室和应用的系统。

测序试剂

查找为每种Illumina测序系统定制的试剂盒,它们包括测序试剂、流动槽,和/或缓冲液。

RNA Express App

通过STAR aligner比对RNA-Seq的序列,并将比对后的序列分配到基因,然后通过DESeq2开展差异表达分析。

TopHat Alignment App

定位序列,开展对参考基因和转录本的丰度估计,检出变异,提供可选的融合检出。

Cufflinks Assembly & Differential Expression (DE) App

组装新转录本,开展对新发现和参考转录本的差异表达分析。

博德研究所的IGV

由麻省理工大学和哈佛大学Broad研究院开发的基因组浏览器,显示用于复杂变异分析的NGS数据。

Genomatix Pathway System (GePS)

将单个基因或基因列表与通路、疾病、组织和小分子的注释数据相关联。

iPathway Guide

差异化基因表达、药物相互作用和疾病分析。

BaseSpace Cloud或Onsite

Illumina的基因组学计算环境,适合NGS数据分析和管理。

NextBio Research

一个不断增长的基因组数据库,可为研究人员鉴定疾病机制、药物靶点和生物标志物提供有力支持。

癌症研究:变异检测
癌症研究:变异检测

癌症积累了大量的遗传改变,但通常只有少数改变能真正推动肿瘤发展。通过total RNA-Seq来监控编码和非编码RNA标志物中的基因表达,能帮助了解哪些变异影响了肿瘤分类和进展。进一步深入了解癌症RNA-Seq。

农业基因组学:深度的转录组测序
农业基因组学:深度的转录组测序

植物有着大型、重复的基因组,这使得低表达的基因难以测序。超深度的RNA测序利用de novo测序和重测序,适合大型转录组的植物研究。进一步深入了解农业基因组学的RNA-Seq。

复杂疾?。和ü齊NA-Seq鉴定生物标志物
复杂疾?。和ü齊NA-Seq鉴定生物标志物

人们已经将各种形式的ncRNA与越来越多的复杂疾病相关联。全转录组RNA测序使研究人员能够在单个分析中研究编码RNA和多种形式的非编码RNA,为复杂疾病的生物学提供一幅完整的图像,有助于发现更广泛的潜在生物标志物。进一步深入了解复杂疾病研究中的RNA-Seq。

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RNA-Seq数据分析
RNA-Seq数据分析

用户友好的软件工具,可简化RNA-Seq数据分析,生物学家无论拥有何种程度的生物信息学经验,都能轻松使用。

了解详情
低质量样本和FFPE样本的总RNA-Seq
低质量和FFPE样本的RNA-Seq

福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本以及其他低质量样本的RNA-Seq为疾病研究提供了有价值的见解。

了解详情
网络研讨会:FFPE RNA-Seq
网络研讨会:FFPE RNA-Seq

了解如何克服FFPE RNA测序中的障碍。

下载网络研讨会
在NextSeq 500系统上执行RNA-Seq
在NextSeq 500系统上执行RNA-Seq

灵活、高性价比的解决方案,适用于使用总RNA-Seq进行全转录组分析的情况,可让您更深入地了解生物学。

查看PDF
主要的RNA-Seq出版物
主要的RNA-Seq出版物

查看专门介绍Illumina技术的RNA-Seq研究出版物可搜索列表。

查看出版物
双末端RNA-Seq
双末端RNA-Seq

所有Illumina测序系统都可以执行双末端测序,这有助于检测新RNA转录本、基因融合等。

了解详情
RNA-Seq和单细胞测序
单细胞测序简介

单细胞测序研究在众多领域的应用呈上升趋势。

观看视频

*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015

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