DNA与蛋白结合序列的精准分析

运用染色质免疫沉淀技术与NGS进行更全面的基因调控全基因组研究

大乐透 双色球:染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq)

超级大乐透中奖规则 www.slf2t.cn 通过染色质免疫沉淀(ChIP)检测和测序技术相结合,ChIP测序(ChIP-Seq)成为鉴定转录因子及其他蛋白因子在全基因组范围内的DNA结合位点的强有力方法。在ChIP操作之后,通过特异抗体将DNA结合蛋白免疫沉淀。结合的DNA被同时沉淀、纯化并测序。

新一代测序(NGS)在ChIP上的应用已经揭示了一些在各种疾病和生物学通路(如发育和癌症发展)中发挥作用的基因调控事件的线索。ChIP-Seq能够在全基因组规模上实现对蛋白与核酸相互作用的全面检测。

  • 可在任何生物体的整个基因组中捕获转录因子或组蛋白修饰的DNA靶点
  • 确定转录因子的结合位点
  • 结合RNA测序和甲基化分析,揭示基因调控网络
  • 可兼容不同起始量的DNA样品
ChIP-Seq的优势

ChIP-Seq可鉴定DNA结合蛋白的结合位点,可用于定位一个给定蛋白的整体结合位点。芯片及其他研究表观基因组的方法往往有着内在的偏向性,因为它们需要来自已知序列的探针,ChIP-Seq则不同,不需要任何先验知识。ChIP-Seq通过大规模并行测序提供全基因组的图谱,产生覆盖多个样品的数百万次计数分析,实现经济且精确的分析。

无偏差的表观遗传模式研究

Illumina的边合成边测序(SBS)技术是全球最广泛采用的NGS技术,已产生了全球大约90%的测序数据。*

不仅仅产生业界领先的数据质量,Illumina还提供从文库制备到数据分析的完整流程,可简化测序。

单击下面的 可查看每个工作流程步骤的产品。

TruSeq ChIP Library Prep Kit
从ChIP来源的DNA中制备ChIP-Seq文库,该方法简单且低成本。
MiSeq系列

专注性,每次运行测序1-6个ChIP-Seq样品。

NextSeq系列

灵活性,可同时测序8-24个ChIP-Seq样品。

HiSeq系列
生产级,平行测序4-150个ChIP-Seq样品,
这取决于感兴趣的目标蛋白。
平台比较工具

比较各种测序平台,选择最适合您的实验室和应用的系统。

测序试剂

寻找每个Illumina测序系统定制的试剂盒,它们包括测序试剂、流动槽,和/或缓冲液。

注意:对于ChIP-Seq,高度靶向的转录因子可能需要较少的reads(500-1500万个),而普遍存在的蛋白,如组蛋白标记抓取,可能需要较多的reads(5000万个)。

ChIP-Seq App

利用MACS2鉴定转录因子的结合位点,并利用HOMER发现尖峰中的motif。

Genomatix Pathway System (GePS)

通路、网络和过程的生成和查看。

BaseSpace Cloud or Onsite

Illumina的基因组学计算环境,适合NGS数据分析和管理。

NextBio Research

一个不断增长的基因组数据库,支持研究人员鉴定出疾病机制、药物靶点和生物标志物。

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*存档数据计算。Illumina, Inc., 2015

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